Orta halli bir hikayeye sahip ama Indy hayranları yine de keyif alabilir.
1950’li yıllarda ilk soğuk savaş dönemindeki Sovyet ajanları, Profesör Henry Jones’u izlemektedirler. Genç bir adam olan Mutt’ın ona şifreli bir mesaj getirdiğine şahit olurlar. Sert bir kadın olan Rus ajan Irina Spalko’nun yanındaki adamları, Jones ve Mutt’ın peşine takılırlar. Indy ve Mutt şifreli mesajı çözerler ve kuvarstan yapılma efsanevi bir kafatası bulurlar. Eğer Jones, kafatasını yasal olarak ait olduğu yere götürebilirse her şey yoluna girecektir. Ancak Irina, onu ele geçirirse, bütün batı dünyasını tehlikeye atacak bir güce sahip olacaktır. Artık biraz yaşlı olan Indy ve genç adam, Jones’un geçmişinden gelen bir kadınla (ilk filmden tanıdığımız Marion) birlikte bazı doğaüstü olaylarla da karşılaştıkları bir maceraya dalarlar.
